تحدث الدكتور "مصطفى الفقى" عن تاريخ الكنيسة المصرية، خلال مقال له نشرته "فيتو"، مؤكداً أنها كنيسة أصيلة وأن الكنيسة "القبطية" تعنى الكنيسة "المصرية".
 

وقال "الفقى" فى مقال له: أن "الكنيسة القبطية تعتبر تجميعًا زمنيًا حيًا للأشكال القديمة للنصرانية مما يؤيد وبدعم فكرة أن الكنيسة القبطية، كنيسة أصيلة ذات طابع كلاسيكي"، مشيرا، أن "الجانب الروحي للأقباط يظهر في تعاليم العقيدة الأرثوذكسية، فمنذ البداية والأقباط الأرثوذكس يتمسكون بمذهب الوحدة الطبيعية والتوحيد، أي طبيعة وجوهر واحد وإرادة واحد للسيد المسيح، ويؤمن قانون العقيدة القبطية بالثالوث المقدس، لكن التوحيد غير المقسم هو السائد والمهمين في عقيدتهم". 
 

وأضاف "الفقى" أن هذه الأمور "قد يتم اعتبارها مسائل ثانوية غير ذات أهمية الآن، لكنها تسببت في العصور القديمة في نشوب حروب، وموجات اضطهاد فيما بين الجماعات المختلفة، وتعتبر الكنيسة القبطية في الجانب المحافظ للكنيسة المسيحية ككل، وتشتهر بشخصيتها المتحفظة مع النفور الواضح من التغيير".