يرفض المعهد الكندي للإسلام الإنساني قرار رئيس الوزراء التركي رجب طيب أردوغان تحويل متحف "آيا صوفيا"، الذي كان في الأصل كنيسة، إلى مسجد واعتبره مخالف للقيم الكلية الإسلامية التي تحترم بشكل مطلق حرية الإعتقاد. وترفض رفضاً قاطعاً أي اعتداء على الأخر المختلف في الدين أو اللون أو الجنس، بما يتناقض مع المواثيق الدولية لحقوق الإنسان. كما انه يسيء إلى صورة المسلمين أمام العالم ويحولهم الى مجرمين يعتدون على حقوق غيرهم.
 وأشار المعهد في بيانه إلى ان الجريمة الأولى كانت غزو محمد الذي يلقبونه ب"الفاتح" سلطان الإمبراطورية الاستعمارية العثمانية للقسطنطينية، واستباحة أموال وأعراض أهلها، ثم تحويل الكنيسة الكبرى آيا صوفيا التي كانت رمزاً للمسيحية في ذلك الوقت إلى مسجد بالقوة.
 
 وأكد المعهد ان محمد الغازي وغيره من الغزاة أساءوا الى الإسلام بتحويله الى دين هدفه استعمار الشعوب ونهبها وتدميرها. وطالب المعهد المؤسسات الدينية في العالم الإسلامي السني والشيعي الى التبرؤ من هذه الجرائم الاستعمارية التي ارتكبها بعض المسلمين، مهما علت قامتهم، منذ بدايات هذا الدين، واخترعوا "اسلام" جديد يبرر لهم دينياً الكراهية والعنف والتمييز والإرهاب. ويطالب المعهد ايضاً بوقف استخدام "النصوص المقدسة" في تبرير الجرائم الاستعمارية، مثل الحديث الذي نسبوه زوراً إلى سيدنا النبي " : (لتُفتحنّ القسطنطينية، ولنِعم الأمير أميرها، ولنِعم الجيش ذلك الجيش). 
 
 وما زال اتباع هؤلاء الغزاة في زمننا واولهم أردوغان الإخواني يصرون على محاولة السيطرة على العالم مجدداً. ولا يجب ان نتحمل نحن كمسلمين وزر جرائم بعض المسلمين الاستعماريين في الماضي والحاضر، ومن العار ان ندافع عنهم وعن هذا النوع من "الإسلام".  فهل يقبل المسلم الطبيعي ان يتم الإستيلاء على مسجد من قبل أي محتل ويحوله الى كنيسة أو معبد يهودي أو ..الخ. هل نقبل ان تحول اسرائيل المسجد الأقصى الى كنيس يهودي؟! فكيف يمكن ان نرفض يحدث ذلك لأنفسنا، في حين نبررعندما يرتكب هذه الجريمة مسلم؟!
 
 بالتأكيد ان كل الأديان تم ارتكاب جرائم باسمها، وتم استخدامها لبناء إمبراطوريات استعمارية، وتم استخدامها لانتهاك حقوق الإنسان، ولكن هذه الشعوب تخلت، بل واعتذرت مراراً عن هذه الجرائم، كما فعل الفاتيكان على سبيل المثال.  
 
 وأكد المعهد في بيانه إلى ان ما يردده الإخوان والإسلاميين من ان محمد الغازي اشترى الكنيسة من الرهبان مجرد كذبة مضحكة لا يوجد دليل تاريخي عليها. ثم انه ليس منطقياً ان السلطان العثماني الغازي المحتل، الذي استولى على المدينة بالكامل، وأمر جنوده باستباحة اموال واعراض واروح أهلها، ان يجلس ويتفاوض لشراء الكنيسة!! فكان من باب أولى ألا ينهب ثروات البلد التي يحتلها. 
 
 أما الجريمة الثانية حسب بيان المعهد بعد جريمة محمد الغازي، هي قيام كمال أتاتورك بتحويل الكنيسة الى متحف، وهذا يشكل اعتداءاً على حرية العبادة وتغيير وظيفة الدولة المحترمة من حماية دور العبادة الى الاستيلاء عليها، وتحويلها الى غرض اخر. أي ان أتاتورك الديكتاتور القومي انتهك بفجاجة حقوق المسيحيين الأتراك والمسيحيين في العالم. ربما من المهم التذكير بان أتاتورك الذي يصفه الإخوان والإسلاميون زوراً بأنه "علماني"، كانت دولته منحازة للتركي المسلم السني، وارتكب مجازر ضد الأقليات ، وحرمتها من حقوقها، فهو الذي بدأ ترحيل وابادة الأقليات من تركيا، وأكمل أردوغان الجريمة من بعده و ببجاحة اكبر.
 
 عندما استولى أردوغان والإخوان الأتراك على الحكم بعد الإطاحة بالجيش ظهرت ايديولوجيتهم الحقيقة، أردوغان قال مراراً وتكرارا يريد بناء "دولة الإسلام الإخوانية"، والتي لا تعترف بحقوق الأقليات، وتعتبرهم مواطنين من الدرجة الثانية وربما العاشرة. ومن بعدها يبني مجدداً الإمبراطورية العثمانية الإستعمارية. هذه الدولة الإسلامية الإخوانية لا تقبل وجود دور عبادة لغير المسلمين في دار الإسلام. 
 
 وشدد المعهد الكندي للإسلام الإنساني ان القضية ليست مجرد خلاف على ملكية مبنى أثري، ولكنه في الحقيقة صراع بين نوعين من الإسلام. اسلام أردوغان الإخواني  الإستعماري الذي يؤمن ان الإسلام دولة وخلافة، والذي ينتهك الحريات والحقوق ويطمح إلى إقامة دولة دينية ديكتاتورية، والى امبراطورية استعمارية تشكل خطراً ليس فقط على الشرق الأوسط، ولكن على العالم كله بما فيه المسلمين. 
 
 الإسلام الآخر، هو الإسلام  الإنساني الذي يقدس الحريات الفردية والعامة، ويقدس حرية الإعتقاد، ويتعامل مع المواطنين على قدم المساواة، وهو ما يرفضه الإخوان في تركيا وكل مكان، ويضخون اموالاً طائلة عبر قطر، لسيادة "اسلام الإخوان" على الشرق الأوسط والعالم كله. هذا الإسلام خطر على المسلمين وعلى العالم. 
 
 وطالب سعيد شعيب مدير المعهد كل دول العالم وخاصة في الغرب للتكاتف للوقوف ضد مشروع أردوغان وعموم الإخوان والإسلاميين في كل مكان في العالم. فوجود ميليشيات أردوغان على الحدود المصرية في ليبيا بتمويل قطري، ليست منفصلة عن سرقة كنيسة آيا صوفيا وتحويلها إلى مسجد. ولا هي  "صراع داخل الشرق الأوسط"، ولكنه لا قدر الله لو سيطر ستكون كارثة، وستكون الخطوة التالية هي تدمير الغرب بحضارته، للسيطرة على العالم.